본래 초기 방송을 시작할 당시에는 신비한TV 서프라이즈처럼 도시전설을 다루는 예능 프로그램에 가까웠으나, 실제 살인 사건을 몇 번 다루다가 악명을 떨쳤던 유명 종교단체인 JMS을 다루면서 본격적인 시사 프로그램으로 변모하였다.
역사가 역사이니만큼 시사 프로그램답지 않게 스토리텔링 위주로 진행되어 마치 범죄극이나 추리극을 보는 듯한 구성으로 인터넷상에서 화제를 많이 모으는 프로그램으로, 일간베스트를 소재로 삼는 등 인터넷의 주요 사건도 의제로 다루기도 한다. 그리고 일반 TV 시청자들에게도 친숙한 프로그램이기 때문에 이 시간대 《그것이 알고 싶다》가 가지는 위상은 매우 크며, 그렇기 때문에 예능계에서 토요일 11시 예능은 유독 부진을 불러오기 때문에 기피하는 상황이 벌어진다. 어느 정도인지 감이 잘 안 잡힌다면 방송 초창기 네이버, 다음의 급상승 검색어를 점령하던 리즈시절의 《마이 리틀 텔레비전》이 겨우 경합을 벌일 정도.
주요 에피소드
대한민국에 정의를 묻다, 1000회
1부 담장 위를 걷는 특권
교도소에 관한 에피소드. 감옥에 간 재벌들이 받는 특혜와, 그에 대조되어 생명까지 위협받는 보통 재소자들을 조명했다.