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젠하기 위한 의도로 나무위키의 여러 특성을 활용하여 젠더 이퀄리즘이라는 가상의 사회 운동 내지 철학 사조를 꾸며내고 허위 정보를 만들어낸 사로, 이에 대한 적지 않은 문제 제기가 있었으나 정정되기까지는 많은 시간이 걸렸다. 
젠더 이퀄리즘 날조 사건
2015 나무위키 리뷰왕 김리뷰 임시조치 사건
2015 리그베다 위키 테러건
2019 나무위키 유튜
2019 나무위키 텔레그램 유출 사건
가정폭력 3차 가해 사건
신사와 아가씨가 미화해서 논란이 되었고, 이를 지적하는 서술이 올라왔다. 그러자 vit는 사용자들을 악랄하게 매도해 모두 차단당하게 만들었다. 나무위키 관리자들은 3차 가해를 한 꼴.
가정폭력 피해자의 80%가 여성이라, 신사와 아가씨, vitamin003, 나무위키 관리자 모두 가정폭력 피해자들뿐만 아니라 여성 자체를 모독한, 최악의 여성혐오 사건이다.
2021년 나무위키 에펨코리아 무단 박제 사건
문제점
나무위키에는 한국 인터의 거의 모든 문제점들이 집대성 된 문제들이 도사리고 있다.
남성우월주의
전반적으로 남성우월주의적인 시각으로 서술된 문서가 많다. [주 1] 주제와 상관없이 언제 어디에서 튀어나올지 알 수 없을 정도이다. 나무위키 이용자들은 일부라고 하지만 이는 관련 문제에 대한 둔감성을 드러내는 주장일 뿐이다. 또한 '김치녀'로 대표되는 여성혐오 단어들이 공중파 티비에도 나오며 흔하게 쓰일 정도 였고, 대표적인 여성혐오 페이스북 페이지인 '김치녀 페이지'의 팔로워가 10만에 육박할 정도로 메갈리아 등장 이전부터 온라인상 여성혐오가 심각했음에도 불구하고, 마치 메갈리아가 젠더 갈등을 일으킨 원인인것처럼 여성혐오와 남성혐오 관련 문서들이 전체적으로 왜곡되어 있다. 나무위키의 여성혐오
문법 문제
엔젤하이로 위키로부터 물려받은 특징적 서술법이 나무위키의 위키 문화 및 다양한 유저층과 만나 나타나는 나무위키만의 문체와 서술 방식에 가독성 등 여러가지 문제들이 있다. 나무위키체
저작권 문제
법률 위반과 저작권에 대한 광범위하며 체계적인 침해도 심각하다. 나무위키의 문제점
불법 사이트 관련 문제
대한민국에서 위법으로 취급하는 성인 웹사이트와 성인물, 불법 공유에 대한 정보가 매우 자세하게 나와 있다.
안티페미니즘
반페미니즘 성향을 적나라하게 드러내고 검열하고 재단하는 부분에 있어서 조치를 가하지 않고 있다. 추측성으로 증거 없는 페미니즘 성향을 검증하려고 그러고, 페미니즘을 혐오하는 성향이 있다. 페미니즘을 혐오스럽다고 재단하고 표현하고 있어서, 여성 인물 정보에 심한 훼손이 있는 경우도 있다.
반페미니즘 남자중심 성향으로, 검증되지 않은 여성들에게 페미니즘 성향을 재단하여 문서를 실추시키는 경우도 있다. 비판에 있어서 가끔 출처가 없는 주관적인 의견이 있는 문서가 너무 많아서 신뢰도가 떨어진다는 의견도 있는 상황이다. 반페미니즘이라는 이유로 여성혐오를 비판하거나, 사회적인 의견에 목소리를 내면 논란 이라고 재단하며 문서를 훼손하는 경우도 있다.
별명
- 좆무위키 - 가장 많이 알려진 별명.
- 돚거위키 - 리그베다 위키에 테러 사건이 일어난 것을 틈타 namu가 리그베다 위키 문서 전부를 도둑질(돚거질)했기 때문이다.
- 꺼라위키 - "나무위키 꺼라"라는 인터넷 밈에서 유래되었다.
- 남간위키
- 꺼무위키
- 담무위키 - 담원 KIA의 팬이 T1의 주장인 페이커에 대해 '인터뷰 논란'을 무리하게 등재했으며, 거기서 그치지 않고 나무위키의 관리자가 담원 KIA 팬들을 편들며 T1 팬들을 영구 차단했기 때문이다.
- 좌무위키 - 주로 보수진영에서 나무위키의 서술 방식이 좌편향이라고 까는 유명한 멸칭이지만, 위에 '교묘한 우편향' 항목에서도 나와 있듯 말도 안되는 주장이다.
- 장작위키
- 센무위키
- 한남위키
- 미국위키 - 이대마와 관련된 문서들을 관리자가 말소시킨 사건으로 인해 분노한 이대마의 지지자들이 이대마가 정치적으로 싫어하는 미국에 빗대어 지은 별명이다.
- 멸빈위키 - 불교연합당의 이대마 장주스님이 즐겨듣는 찬가를 작성하였으나, 관리자가 나서서 장주찬가를 검열하고 승병들을 멸빈시켰다. 이대마 후보가 마치 죽은 것 처럼 "아무 일도 안 한다"라며 구설수를 늘어놓았는데, 이대마는 최근에 요양원에서 잘 지내고 있는 모습이 포착되어 또다시 멸빈의 행보를 보였다.
이렇게 좋지 않은 별명이 많은 이유는 나무위키가 '중립 및 보편'을 자칭하면서 정작 실질적으로는 위키백과와 같은 NPOV적 시각이 아닌 비학술적인 양비론을 피거나 교묘하게 특정 세력을 편들며 반대편을 악마화하는 서술을 함으로써 적을 많이 만들었기 때문이다.
괜찮은 문서
나무위키 문서 상당수는 남초의 영향을 받고 있고 그로 인해 소수자 혐오적 서술이 적지 않지만 드물게 간혹 볼 만한 문서들도 있다.
해당 문서들은 나무위키가 나무위키 하지 않은, 읽을 만한 몇 안되는 문서들이다. 특히 자폐 스펙트럼과 관련된 문서들은 의외로 다른 위키들과 비교했을 때 차별혐오적 서술이 비교적 적게 나타나며 당사자 중심적인 견해가 상당히 반영되어 있다.
언론 보도
- ① 나무위키를 믿습니까?, ize, 2016.06.21
- ② 나무위키를 수정해보자, ize, 2016.06.21.
- ③ 나무위키의 이것을 경계할 것, ize, 2016.06.21
- 183a. 좁은 숲이 키운 거대한 나무, 그것은 알기 싫다, 2016.07.14.
- 강남 살인사건 발생 70일…꺼지지 않는 ‘여남 전쟁’ 불씨, 연합뉴스, 2016, 07.25 - 해당 기사에서는 "갈등의 한쪽에는 국내 최대 온라인 지식백과 사이트 '나무위키'를 필두로 한 남성 네티즌이 있다. 평소 메갈리아를 반사회 성향 사이트로 규정하던 사이트다. 그 대척점에 메갈리아와 여성주의 성향 트위터 이용자들이 서 있다"라고 쓰고 있다.
- 나무위키 김자연 성우 지지자 명단 논란
- 진중권은 "나도 메갈리안이다"라는 글을 썼고, 나무위키에 이름을 올렸다, 허핑턴 포스트, 2016.07.28
- 나무위키, 명예훼손 내용 담은 문서로 문제 많아
- [http:/까]
==나무
- 나무미위키
나무
그
==같이
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- [[있다.
다.
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렸다.
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